合并hyprcoloc_prepare()预筛选数据,并生成用于分析和作图的数据。

Usage,
hyprcoloc_merge(prepare_data, out_path = "./")

参数

prepare_data

hyprcoloc_prepare()预处理返回的数据

out_path

文件输出路径

chrompos

染色体区域,一个或多个,形如:"2:26496839-28523684"

Examples


# 方法一,使用hyprcoloc_prepare()获取。
prepare_data <- hyprcoloc_prepare(
  file_paths = c(
    "hg19_avsnp151_腹主动脉瘤meta-AAAgen-final-sumstat.txt",
    "冠心病GCST90132315.h.txt",
    "心肌梗死GCST011364.h.txt"
  ),
  chrompos = c("1:55005647-56005647", "10:90502927-91502927"),
  traits = c("AAA", "CAD", "MI"),
  out_path = "./test/hyprcoloc"
)

# 方法二,读取hyprcoloc_prepare()生成的.rds文件
# prepare_data <- readRDS("hyprcoloc_prepare_data.rds")

# 使用hyprcoloc_merge(), 合并预筛选数据,并生成用于分析和作图的数据。
merge_data <- hyprcoloc_merge(
 prepare_data = prepare_data,
 out_path= "./test/hyprcoloc"
)