hyprcoloc_merge.Rd合并hyprcoloc_prepare()预筛选数据,并生成用于分析和作图的数据。
hyprcoloc_merge(prepare_data, out_path = "./")hyprcoloc_prepare()预处理返回的数据
文件输出路径
染色体区域,一个或多个,形如:"2:26496839-28523684"
# 方法一,使用hyprcoloc_prepare()获取。
prepare_data <- hyprcoloc_prepare(
file_paths = c(
"hg19_avsnp151_腹主动脉瘤meta-AAAgen-final-sumstat.txt",
"冠心病GCST90132315.h.txt",
"心肌梗死GCST011364.h.txt"
),
chrompos = c("1:55005647-56005647", "10:90502927-91502927"),
traits = c("AAA", "CAD", "MI"),
out_path = "./test/hyprcoloc"
)
# 方法二,读取hyprcoloc_prepare()生成的.rds文件
# prepare_data <- readRDS("hyprcoloc_prepare_data.rds")
# 使用hyprcoloc_merge(), 合并预筛选数据,并生成用于分析和作图的数据。
merge_data <- hyprcoloc_merge(
prepare_data = prepare_data,
out_path= "./test/hyprcoloc"
)