hyprcoloc多性状共定位-1筛选 — hyprcoloc

预处理，根据染色体区域筛选数据。以第一个文件的染色体区域为准，第二个文件开始以第一个文件的SNP进行筛选。

Usage,

hyprcoloc_prepare(
  file_paths,
  chrompos = NULL,
  traits = NULL,
  binary.outcomes = NULL,
  out_path = "./"
)

参数

file_paths: gwas文件，一个或多个，必须是标准的MR文件
chrompos: 染色体区域，一个或多个，形式如："2:26496839-28523684"
traits: gwas文件别名，默认为文件名。如填写，必须与与file_paths一一对应。
binary.outcomes: 输入GWAS文件对应的性状，如果是二分类记为1，反之则记为0。多个性状需要分开写，如c(1,1,0)。
out_path: 文件输出路径

Examples

prepare_data <- hyprcoloc_prepare(
  file_paths = c(
    "hg19_avsnp151_腹主动脉瘤meta-AAAgen-final-sumstat.txt",
    "冠心病GCST90132315.h.txt",
    "心肌梗死GCST011364.h.txt"
  ),
  chrompos = c("1:55005647-56005647", "10:90502927-91502927"),
  traits = c("AAA", "CAD", "MI"),
  out_path = "./test/hyprcoloc"
)