smr分析处理gwas标准文件

删除缺失rsid、删除缺失freq行；rsid存在多个情况下，保留第一个rsid；

Usage,

smr_prepare_ma(file_path = " ", out_path = "./")

参数

file_path

smr标准文件(.ma)文件路径，数据中需要包含列名：SNP,A1,A2,freq,b,se,p,n。

out_path

输出文件路径

值

处理后的.ma文件

Examples

smr_prepare_ma(
file_path = "finngen_R9_C3_MELANOMA_EXALLC.ma",
out_path = "./"
)