散点图

散点图

Usage,

smr_plot_effect(
  smr_data,
  trait_name = "",
  cisWindow = 2000,
  transWindow = 5000,
  pointsize = 20,
  pdf = F,
  height = 8,
  width = 8,
  out_path = "./",
  out_prefix = "my"
)

参数

smr_data

smr_plot_prepare输出的数据

trait_name

指定GWAS图上显示的性状或疾病的名称。

cisWindow

以探针为中心的窗口大小

transWindow

以探针为中心的窗口大小

pointsize

横坐标、纵坐标和标题对应标题字体的大小，默认为20。

pdf

是否输出到pdf

height

输出pdf图片的高度，默认为8。

width

输出pdf图片的宽度，默认为8。

out_path

pdf 输出路径，默认当前路径

out_prefix

输出pdf文件的前缀

值

绘图结果

Examples

smr_plot_effect(smr_data = SMRData,trait_name = "ieu-a-7")