IEU在线数据多因素MR分析

Usage,

mr_online_multiple(
  ieu_exp_id = c(),
  exp_p = 5e-08,
  pop = "EUR",
  clump_r2 = 0.001,
  clump_kb = 10000,
  find_proxy = T,
  ieu_out_id = c(),
  out_p = 1e-05,
  rsq = 0.8,
  maf_threshold = 0.3,
  align_alleles = 1,
  palindromes = 1,
  pval_threshold = 5e-08,
  out_path = "./"
)

参数

ieu_exp_id: 多暴露id，需要输入不少于2个暴露的id
exp_p: 指定与任一暴露相关的p值的阈值，默认是5e-8。通过该阈值，筛选与暴露相关的snp。
pop: 在线clump，指定人群，默认是"EUR"
clump_r2: 同ieugwasr::ld_clump()的clump_r2
clump_kb: 同ieugwasr::ld_clump()的clump_kb
find_proxy: 是否寻找代理工具变量
ieu_out_id: ieu数据库中结局的id号，只能1个
out_p: 指定与结局相关的p值的阈值，默认是1e-5。通过该阈值，排除与结局相关的snp。
rsq: 最小LD rsq值（如果find_proxy = T）。默认值=0.8
maf_threshold: MAF阈值，试图推断回文SNPs。默认值为0.3。
align_alleles: 尝试将标记等位基因与目标等位基因对齐（如果find_proxy = T）。1=是，0=否。默认值为1。
palindromes: 允许使用回文SNPs（如果find_proxy = T）。1=是，0=否。默认值为1。
pval_threshold: 多因素分析p值的阈值，默认是5e-8。
out_path: 输出文件的路径，默认为当前路径“./”

值

多因素分析结果文件

Examples

mr_online_multiple(ieu_exp_id =c("ieu-a-299","ieu-a-300", "ieu-a-302"),
ieu_out_id = c("ieu-a-7"))