mr_local_harmonised.Rd当多效性分析提示MR分析中的工具变量存在多效性的时候,可以基于table_s1_harmonise_data.csv进行mr_add_presso分析,
排除存在多效性的SNP之后,将生成table_s1_harmonise_data(outlier_filtered).csv,该文件可作为mr_local_harmonised的输入文件,再次进行MR分析。
mr_local_harmonised(
harmonise_data = "",
mr_methods = c("mr_wald_ratio", "mr_ivw", "mr_weighted_median", "mr_two_sample_ml",
"mr_egger_regression"),
out_path = "./"
)输入table_s1_harmonise_data.csv或者table_s1_harmonise_data(outlier_filtered).csv文件地址
mr分析中用到的方法,同TwoSampleMR::mr_method_list()
指定输出文件的路径
mr分析结果
mr_local_harmonised(
harmonise_data="./table_s1_harmonise_data(outlier_filtered).csv",
out_path = "./"
)