本地提取多因素暴露数据 — mr_extract_exposure_local

本地提取多因素暴露数据

Usage,

mr_extract_exposure_local_mv(
  local_exp_path = c(),
  exp_p = 5e-08,
  clump_r2 = 0.001,
  clump_kb = 10000,
  clump_method = 1,
  bfile = NULL,
  plink_exe = get_plink_exe()
)

参数

local_exp_path: 本地暴露数据列表
exp_p: 指定与暴露相关的p值的阈值，默认是5e-8。通过该阈值，筛选与暴露相关的snp。
clump_r2: ieugwasr::ld_clump函数中的clump_kb
clump_kb: ieugwasr::ld_clump函数中的clump_r2
clump_method: clump使用方法，默认 1。 1，基于pval；2，基于1/zscore；3，当pval==0使用1/zscore正排序A1，当pval>0使用pval正排序A2，按照A1A2拼接，并给一个分数
bfile: bfile指定参考文件的位置
plink_exe: plink，默认内置最新plink工具。

值

多因素暴露数据

Examples

exposure <- mr_extract_exposure_local_mv(
local_exp_path = c("./ieu-a-300.txt","./test/ieu-a-3001.txt"),
bfile = "./data/eur/EUR")