MR中介分析

MR中介分析

Usage,

mr_analysis_mediation(
  e2o_path = NULL,
  e2m_path = NULL,
  m2o_path = NULL,
  em2o_path = NULL,
  method_uvmr = c("Wald ratio", "Inverse variance weighted"),
  method_mediation = 1,
  out_path = "./",
  out_prefix = "analysis"
)

参数

e2o_path

暴露与结局单因素MR分析结果table_s2_mr_results.csv

e2m_path

暴露与中介单因素MR分析结果table_s2_mr_results.csv

m2o_path

中介与结局单因素MR分析结果table_s2_mr_results.csv

em2o_path

暴露、中介与结局多因素MR分析结果 table_s2_mr_results(ivw多因素MR分析).csv或table_s2_mr_results(basical多因素MR分析).csv,

method_uvmr

在进行暴露-中介-结局两两间MR分析步骤中，选用哪些方法对应的mr结果用于中介效应计算，默认为： c("Wald ratio","Inverse variance weighted")。

method_mediation

进行中介分析的方法。目前涵盖了3种方法，分别对应1,2,3。默认方法1。 当method_mediation = 1,需要传入参数e2o_path、e2m_path和m2o_path； 当method_mediation = 2或3, 需要传入参数e2o_path、e2m_path和em2o_path。 1，两步法中介MR分析，未校正暴露的作用以计算中介与结局的效应（间接效应=暴露与中介 * 中介与结局）， 参考文献：Burgess S, Daniel RM, Butterworth AS, Thompson SG; doi:10.1093/ije/dyu176; Yuan S, Xu F, Zhang H, et al. doi:10.1016/j.jtha.2023.11.013。 2，两步法中介MR分析，校正暴露的作用以计算中介与结局的效应（间接效应=暴露与中介 * 中介与结局） 参考文章：Carter AR, Sanderson E, Hammerton G, et al. doi:10.1007/s10654-021-00757-1。 3，基于多因素MR分析的结果计算中介效应（间接效应=总效应-直接效应），也称差值法， 参考文章：Carter AR, Sanderson E, Hammerton G, et al. doi:10.1007/s10654-021-00757-1

out_path

指定输出文件的地址

out_prefix

输出文件前缀

值

MR中介分析结果文件

Examples

mr_analysis_mediation(e2o_path = "./e2o_table_s2_mr_results.csv",
e2m_path  = "./e2m_table_s2_mr_results.csv",
m2o_path  = "./m2o_table_s2_mr_results.csv",
method_mediation = 1,
out_path = "./",
out_prefix = 1)