升级版：寻找eaf数据，基于1000基因组项目

基于annovar数据进行eaf匹配，需要指定到对应参考文件数据路径。 注意事项：

• 此方法使用chr pos effect_allele other_allele，因此需要保证注释数据与gwas数据坐标轴一致。

• 纯R匹配，请保证内存充足

Usage,

get_eaf_from_g1000_pro(
  file_path,
  g1000_eaf_path,
  out_path = "./",
  out_prefix = "eaf"
)

参数

file_path

用于mr分析的标准数据路径

g1000_eaf_path

指定到参考数据对应文件路径

out_path

指定输出结果的地址，默认是当前工作路径"./"。

out_prefix

输出文件前缀

Examples

get_eaf_from_g1000_pro(
  file_path = "./ieu-a-2.txt",
  g1000_eaf_path ="./data/hg19_EUR.sites.2015_08.txt"
)