fusion输入GWAS数据预处理

fusion输入GWAS数据预处理

Usage,

fusion_prepare_sumstat(file_path = "", out_path = "./", out_prefix = NULL)

参数

file_path

用于转换成.sumstats的输入文件，必须是mr分析的标准输入文件。可以是一个或者多个,数据中需要包含列名：SNP,effect_allele,other_allele,eaf,beta,se,pval,samplesize,chr,pos。

out_path

输出文件的路径

out_prefix

输出文件的前缀，默认为NULL。

值

返回输出文件路径。

Examples

fusion_prepare_sumstat(
file_path =  "./data_prepare/finngen_R10_G6_MIGRAINE_treated.txt",
out_path = "./data_prepare/"
)