GEO来源matrix矩阵预处理,获取样本的临床信息

Usage,
DEG_prepare_GEOmatrix_meta(file_path = "", out_path = "./")

参数

file_path

从GEO网站下载的含有临床信息matrix矩阵,例如https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/GSE112nnn/GSE112366/matrix/

out_path

输出文件的路径,默认为当前工作路径。

comment.char

在matrix矩阵中,指定其使用的注释符号。常用的注释符号是"!",所以函数中默认为"!"。如果为其他注释符,则需要自定义指定。

Examples

DEG_prepare_GEOmatrix_meta(file_path = "GSE112366_series_matrix.txt.gz",out_path = "./")